Sinds het in 1962 gesloten Verdrag van New York maakt Papoea deel uit van Indonesië. Er woedt echter al tientallen jaren een opstand, waarbij een grote rol is weggelegd voor de Beweging Vrij Papoea (OPM). De rebellie kostte naar schatting honderdduizend Papoea's, eenzesde van de bevolking, het leven.
Clinton zei dat de provincie steun verdient 'in haar pogingen een mate van autonomie te verkrijgen'. Zij legde de verklaring af in antwoord op vragen van Eni F.H. Faleomavaega, een lid zonder stemrecht van het Huis van Afgevaardigden. Faleomavaega is afgevaardigde van Samoa en een bekend criticus van de Indonesische regering.
Nederland werd in 1962 onder druk van de VS gedwongen Nederlands Nieuw-Guinea af te staan aan Indonesië.